קשריו של בן-גוריון עם ירושלים הם קשרים ענפים שנפרשו על-פני עשרות שנים. ירושלים הייתה בעבורו עיר ממשית בה התגורר בצעירותו ובבגרותו, אבל גם אתר לאומי בעל ערך סמלי כבירה ההיסטורית של העם היהודי שיש לה תפקיד בתקומתו.

בן-גוריון עמד בראש הסוכנות היהודית בשנים הסוערות בין 1935 ל-1948. לאורך כל שנות מנהיגותו היה קשור בהסתדרות הציונית בקרן הקיימת ובקרן היסוד. בשנת 1949 קבע בן גוריון את משכנם של מוסדות המדינה בעיר ובכך הפך אותה למוקד של הממלכתיות הישראלית, סמל לקשר בין המדינה לאזרח ומוקד למעורבות אזרחית בניהול המרחב המשותף.

המכון למורשת בן-גוריון מעמיד שלוחה בירושלים שתהווה מוקד חינוכי העוסק בתכני ציונות, וממלכתיות. מורשת בן-גוריון תהווה אבן דרך לכל ארגון הרוצה לעסוק בתכנים הללו ומוקדם בירושלים.

באמצעות סיורים, סדנאות וסמינרים בשלוחה הירושלמית נעמוד על מושג ה'ממלכתיות' בתפיסתו של דוד בן-גוריון והרלוונטיות שלה לימינו, נעסוק בתכנים ציוניים היסטוריים ורלוונטיים ונפעל לחיזוק מעמדה של ירושלים כבירה היסטורית וממלכתית.